S
- (Kazlų Rūda Municipality) Sena Rūda
- (Kazlų Rūda Municipality) Stepkiškė
- (Sakiai) Stainiškė
- (Kazlų Rūda Municipality) Skučiškė
- (Kazlų Rūda Municipality) Slabada
- (Kazlų Rūda Municipality) Smalinpetis
- (Kazlų Rūda Municipality) Salniškė
- (Marijampolė Municipality) Smalinyčia
- (Marijampolė Municipality) Svirnaviečiai
- (Marijampolė Municipality) Svirnaviečiai
- (Vilkaviškis District Municipality) Senkiškiai
- (Kazlų Rūda Municipality) Selema
- (Kazlų Rūda Municipality) Senovė
- (Sakiai) Skubrai
- (Sakiai) Spruktiškė
- (Sakiai) Sabinė
- (Sakiai) Savinė
- (Sakiai) Spruktai
- (Kazlų Rūda Municipality) Sasnava
- (Kazlų Rūda Municipality) Storiesiai
- (Kazlų Rūda Municipality) Skirkai
- (Sakiai) Sparviniai
- (Kazlų Rūda Municipality) Sūkuriškė