E
- (Tamana Shi) Eboshi
- (Kumamoto Shi) Ezumachi-shigedomi
- (Kumamoto Shi) Egoe
- (Kumamoto Shi) Enakajima
- (Shimomashiki-gun) Ejino
- (Amakusa Shi) Etsusaki
- (Amakusa Shi) Enoura-sumori
- (Amakusa Shi) Egawa-funae
- (Amakusa Shi) Eguchi
- (Amakusa Shi) Enoura
- (Kamiamakusa Shi) Ebito
- (Kamiamakusa Shi) Ego
- (Tamana-gun) Ekidōri
- (Arao Shi) Enokibaru
- (Kumamoto Shi) Ezumachi-tokorojima
- (Tamana Shi) Enokibaru
- (Tamana Shi) Eianji
- (Tamana Shi) Eitokuji
- (Tamana Shi) Ekimae
- (Yamaga Shi) Edakawauchi
- (Tamana-gun) Ekōji
- (Tamana-gun) Enokibaru
- (Tamana-gun) Eguri
- (Kōshi Shi) Enokinomoto
- (Kōshi Shi) Era
- (Minamata Shi) Ezoe
- (Tamana-gun) Eta
- (Uto Shi) Ekimae
- (Ashikita-gun) Enokigawauchi
- (Ashikita-gun) Ebirase