E
- (Yatsushiro Shi) Eri
- (Kuma-gun) Eshiro
- (Kuma-gun) Edagōchi
- (Kuma-gun) Enokida
- (Kuma-gun) Enbai
- (Kuma-gun) Ekidōri
- (Kuma-gun) Ekidōri
- (Kikuchi-gun) Ekimae
- (Uto Shi) Ebe
- (Uto Shi) Eri
- (Uto Shi) Ezukamachi
- (Kuma-gun) Ebirase
- (Uki Shi) Ebisumachi
- (Yatsushiro Shi) Ekimae
- (Yatsushiro Shi) Enokimachi
- (Yatsushiro Shi) Emukai
- (Yatsushiro Shi) Ebisu
- (Kumamoto Shi) Edamizo
- (Kumamoto Shi) Endaiji
- (Kumamoto Shi) Ezu
- (Kumamoto Shi) Enokimachi
- (Kumamoto Shi) Ezuhigashi
- (Kumamoto Shi) Ezumachi-kamimuta
- (Kumamoto Shi) Ezumachi-shimomuta