S
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Seruawan
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Saweli
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Solebatai
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Sarisa
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Siaputih
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Saluku
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Serani
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Sanahuni
- (Kabupaten Maluku Tengah) Said
- (Kabupaten Maluku Tengah) Suli
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Sukaraja
- (Kabupaten Buru) Siahoni
- (Kabupaten Buru) Sinopati
- (Kota Ambon) Sojadiatas
- (Kota Ambon) Sojadibawah
- (Kota Ambon) Suakodo
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Solas
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Silohan
- (Kabupaten Maluku Tengah) Seliha
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Sanahu
- (Kabupaten Buru) Samithele
- (Kota Ambon) South Leitimur
- (Kabupaten Maluku Tengah) Sahulau
- (Kabupaten Maluku Tengah) Soloatun
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Sutralan
- (Kabupaten Buru) Sawah Dua
- (Kabupaten Kepulauan Aru) Selmana
- (Kabupaten Maluku Tenggara Barat) Seramosrie
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Sirgurusi
- (Kabupaten Maluku Tengah) Samet