Z
- (Okres Jindřichův Hradec) Zvůle
- (Okres Písek) Zvíkov
- (Okres České Budějovice) Zvěrkovice
- (Okres Prachatice) Zvěřetice
- (Okres Český Krumlov) Zubčická Lhotka
- (Okres Český Krumlov) Zrcadlová Huť
- (Okres Písek) Zlučín
- (Okres Písek) Zlivice
- (Okres Strakonice) Zlešice
- (Okres České Budějovice) Zlatá Studna
- (Okres Český Krumlov) Zlatá
- (Okres Tábor) Zhoř
- (Okres Tábor) Zhoř
- (Okres Písek) Zelendárky
- (Okres Strakonice) Zechovice
- (Okres Český Krumlov) Zdíky
- (Okres Prachatice) Zdíkovec
- (Okres Jindřichův Hradec) Zdešov
Ž
- (Okres České Budějovice) Žumberk
- (Okres Český Krumlov) Žumberk
- (Okres Jindřichův Hradec) Žofina Huť
- (Okres Prachatice) Žlíbky
- (Okres Český Krumlov) Žlábek
- (Okres Prachatice) Žitná
- (Okres Jindřichův Hradec) Žiteč
- (Okres Jindřichův Hradec) Žišpachy
- (Okres Prachatice) Žírec
- (Okres Prachatice) Žíchovec
- (Okres Český Krumlov) Žestov
- (Okres Písek) Žebrákov