J
- (Okres Jindřichův Hradec) Jednota
- (Okres Prachatice) Jaroškov
- (Okres České Budějovice) Jaroslavice
- (Okres Písek) Jarotice
- (Okres Český Krumlov) Jasánky
- (Okres Český Krumlov) Javoří
- (Okres Tábor) Javoří
- (Okres Prachatice) Javornice
- (Okres Prachatice) Javorník
- (Okres Český Krumlov) Javory
- (Okres Český Krumlov) Jaronín
- (Okres České Budějovice) Jedovary
- (Okres Strakonice) Jedraž
- (Okres Písek) Jehnědno
- (Okres Písek) Jehnědsko
- (Okres Prachatice) Jelemek
- (Okres Prachatice) Jelení
- (Okres Český Krumlov) Jelm
- (Okres České Budějovice) Jelmo
- (Okres Český Krumlov) Jankov
- (Okres Český Krumlov) Jablonec
- (Okres Prachatice) Jáchymov
- (Okres České Budějovice) Jakule
- (Okres Prachatice) Jáma
- (Okres České Budějovice) Jamné
- (Okres Tábor) Jamník
- (Okres Písek) Jamný
- (Okres Český Krumlov) Jámy
- (Okres Jindřichův Hradec) Jemčina
- (Okres Tábor) Janov