S
- (Provincia de Maynas) Saboya
- (Provincia de Maynas) San Rafaél
- (Provincia de Maynas) San Juan de Yanayacu
- (Datem del Marañón) Shoroyacocha
- (Provincia de Maynas) San Augusto
- (Mariscal Ramon Castilla) San Nicolás
- (Provincia de Maynas) San Juan de Huashalado
- (Datem del Marañón) Sabaloyacu
- (Provincia de Loreto) San José de Nueva Esperanza
- (Provincia de Ucayali) Santoa
- (Provincia de Loreto) San Jacinto
- (Mariscal Ramon Castilla) Soplín Vargas
- (Provincia de Alto Amazonas) San Miguel
- (Provincia de Maynas) San Pedro
- (Provincia de Maynas) Serafín Filomeno
- (Mariscal Ramon Castilla) Shishita
- (Provincia de Alto Amazonas) Sanango
- (Provincia de Loreto) Santa Fe
- (Provincia de Maynas) San Antonio de Arambaza
- (Provincia de Loreto) San Pedro
- (Provincia de Ucayali) Santa Rosa de Cashiboya
- (Provincia de Maynas) Soledad
- (Provincia de Maynas) Santa Rosa
- (Provincia de Maynas) San José de Omaguas
- (Provincia de Maynas) San Rafael
- (Provincia de Maynas) Santa Victoria
- (Provincia de Ucayali) Shanaillo
- (Provincia de Loreto) Shapajilla
- (Provincia de Requena) San Vicente
- (Provincia de Maynas) San Antonio