S
- (Lauricocha) Siqui
- (Lauricocha) Sopamachay
- (Provincia de Huánuco) Sirau
- (Provincia de Huánuco) Santo Domingo
- (Provincia de Huánuco) Suihua
- (Provincia de Huánuco) Shone
- (Provincia de Huánuco) Salleria
- (Provincia de Huánuco) Secsipucro
- (Provincia de Dos de Mayo) Santiago
- (Provincia de Huánuco) San Antonio
- (Provincia de Huánuco) Sacsa
- (Provincia de Huánuco) Shunshuya
- (Provincia de Huánuco) Shiri Pata
- (Provincia de Huánuco) San Pedro de Cani
- (Provincia de Huánuco) Seclín
- (Provincia de Huánuco) Suyhua
- (Provincia de Huánuco) Sumaranpampa
- (Provincia de Huánuco) San Juanpampa
- (Provincia de Huánuco) San Isidro
- (Provincia de Pachitea) San Juan
- (Provincia de Huánuco) Sagra Huasi
- (Provincia de Huánuco) Shishmay
- (Provincia de Huánuco) Sumarán
- (Provincia de Huánuco) Shogosmonte
- (Provincia de Huánuco) Shacha
- (Provincia de Huánuco) Sogobamba
- (Provincia de Huánuco) Shiracalla
- (Provincia de Huánuco) Sogosogo
- (Provincia de Dos de Mayo) Sicsipata
- (Provincia de Leoncio Prado) Sangapilla