S
- (Trakai) Serapiniškės
- (Trakai) Senieji Tarpupiai
- (Trakai) Senasis Tarpupis
- (Vilnius) Senasalis
- (Trakai) Semeniškės
- (Elektrėnai) Semeliškės
- (Šalčininkai) Sėlė
- (Trakai) Seimėnai
- (Sirvintos) Sedūnai
- (Ukmergė) Savidonys
- (Vilnius) Savičiūnai
- (Trakai) Sausiai
- (Ukmergė) Sarosčiai
- (Svencionys) Sariai
- (Trakai) Sarginė
- (Ukmergė) Sargeliai
- (Trakai) Samninkai
- (Ukmergė) Samantonys
- (Vilnius) Santaka
- (Ukmergė) Saliečiai
- (Vilnius) Sakiškės