S
- (Zarasai) Saločiai
- (Zarasai) Sabutoniškė
- (Zarasai) Skirna
- (Zarasai) Skiduliškė
- (Zarasai) Smalvelės
- (Ignalina) Stanionys
- (Visaginas) Skryteliai
- (Visaginas) Stabatiškė
- (Ignalina) Stašionys
- (Zarasai) Stačiūnai
- (Zarasai) Sterlionys
- (Zarasai) Sauliakalnis
- (Zarasai) Schedai
- (Ignalina) Siūlėnai
- (Ignalina) Silvestriškė
- (Ignalina) Smėliai
- (Ignalina) Smilginiškė
- (Ignalina) Sliesoriškė
- (Ignalina) Siulgos
- (Ignalina) Smilginiškė
- (Ignalina) Sriūbos
- (Ignalina) Simiškė
- (Ignalina) Svylė