E
- (Anykščiai) Ertėjai
- (Ignalina) Erzvėtas
- (Anykščiai) Egliai
- (Anykščiai) Erškėtynė
- (Moletai) Ežerys
- (Utena) Ežeraičiai
- (Moletai) Emelinava
- (Utena) Eizeliškiai
- (Anykščiai) Elmiškis
- (Anykščiai) Elmininkai II
- (Ignalina) Egliniai
- (Moletai) Egiptas
- (Zarasai) Ešerinė
- (Zarasai) Eibutiškis
- (Zarasai) Eiveniai
- (Ignalina) Eglyniškė
- (Ignalina) Ežeriškė
- (Zarasai) Eikotiškis
- (Zarasai) Eglytė
- (Ignalina) Ežeriškė