S
- (Raseiniai) Smukėnai
- (Kaunas) Smiltynai I
- (Kaišiadorys) Smilgiai
- (Raseiniai) Smeltynė
- (Kėdainiai) Slikiai
- (Kaišiadorys) Slajos
- (Raseiniai) Slabada
- (Raseiniai) Skudžiūnai
- (Kaišiadorys) Skudeniai
- (Jonava) Skrynės
- (Jonava) Skripteliai
- (Prienai) Skriaudžiai
- (Kaunas) Skrebiniškiai
- (Jonava) Skrebinai
- (Prienai) Skirptiškė
- (Raseiniai) Skirmantiškė
- (Kėdainiai) Skirgailinė
- (Kaišiadorys) Skėriai
- (Kėdainiai) Skerdikai
- (Raseiniai) Skaraitiškė
- (Kėdainiai) Skaistgiriai
- (Kaunas) Sitkūnai II
- (Kaunas) Sitkūnai