S
- (Provincia di Lecce) San Ligorio
- (Provincia di Lecce) Sant'Elia
- (Bari) Scarpara
- (Provincia di Lecce) Scala di Furno
- (Provincia di Brindisi) Santoro
- (Provincia di Taranto) Sterpine
- (Provincia di Brindisi) Sorbola
- (Provincia di Lecce) Saraceni
- (Provincia di Brindisi) Salinelle
- (Provincia di Lecce) Salmenta
- (Provincia di Foggia) Strada del Salice Onc 516
- (Provincia di Brindisi) Specchiaruzzo
- (Provincia di Taranto) Sanarica
- (Provincia di Brindisi) Specchiolla
- (Provincia di Foggia) Segezia
- (Provincia di Taranto) Stazione Nasisi
- (Provincia di Brindisi) Sisto
- (Provincia di Lecce) Schillanti
- (Provincia di Foggia) San Nicola di Tremiti
- (Provincia di Lecce) Spagnulo
- (Provincia di Taranto) San Donato
- (Provincia di Lecce) Santa Barbara
- (Bari) San Bartolomeo
- (Bari) Scamardella
- (Provincia di Lecce) San Dana
- (Provincia di Foggia) San Salvatore
- (Bari) San Vito
- (Provincia di Foggia) Scialara
- (Provincia di Foggia) San Menaio
- (Provincia di Foggia) Scalo dei Saraceni