S
- (Kabupaten Mappi) Soba
- (Kabupaten Merauke) Sibenda
- (Kabupaten Mappi) Seweru
- (Kabupaten Merauke) Seri
- (Kabupaten Mappi) Serayam
- (Kabupaten Merauke) Sendooko
- (Kabupaten Mappi) Semeh
- (Kabupaten Mappi) Sarabih-anim
- (Kabupaten Mappi) Sarabih
- (Kabupaten Merauke) Sanggase
- (Kabupaten Asmat) Saowa
- (Kabupaten Merauke) Samgalum
- (Kabupaten Merauke) Sakelulun
- (Kabupaten Mappi) Sabariba
- (Kabupaten Asmat) Sabang
- (Kabupaten Merauke) Sugi
- (Kabupaten Merauke) Subobbe
- (Kabupaten Merauke) Sowau
- (Kabupaten Boven Digoel) Sosohneh
- (Kabupaten Merauke) Soheh
- (Kabupaten Merauke) Simininne
- (Kabupaten Merauke) Silierle
- (Kabupaten Merauke) Sidoyadke