M
- (Kabupaten Buru) Masarete
- (Kabupaten Buru Selatan) Malilai
- (Kota Ambon) Martafons
- (Kabupaten Maluku Tengah) Mamua
- (Kabupaten Maluku Tengah) Morela
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Muruwe
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Masikajaya
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Maruwe
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Moa
- (Kabupaten Buru Selatan) Mefa
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Maheleta
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Melukuai
- (Kabupaten Kepulauan Aru) Meroor
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Metatna
- (Kabupaten Maluku Tenggara Barat) Meyanubab
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Mida
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Miran
- (Kabupaten Buru) Mnamuk
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Mattelin
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Moa Island
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Moanga
- (Kabupaten Buru Selatan) Moifkakun
- (Kabupaten Buru Selatan) Moneolon
- (Kabupaten Kepulauan Aru) Murai
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Mun
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Mungasinis
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Murnaten
- (Kabupaten Maluku Tengah) Maraina
- (Kabupaten Maluku Tenggara Barat) Makamdasse
- (Kabupaten Maluku Tengah) Mahariki