D
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Dudumahan
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Duwara
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Dawang
- (Kabupaten Maluku Barat Daya) Dirkuun
- (Kabupaten Buru Selatan) Derlalih
- (Kota Ambon) Dorianpatah
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Daii
- (Kota Tual) Dumar
- (Kota Tual) Defur
- (Kota Tual) Dulahlaut
- (Kabupaten Seram Bagian Barat) Dataran Hunipopu
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Debut
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Dian
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Danar
- (Kabupaten Maluku Tenggara) Dangar
- (Kabupaten Kepulauan Aru) Dalem
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Derak
- (Kabupaten Kepulauan Aru) Doka
- (Kabupaten Seram Bagian Timur) Dulak
- (Kota Tual) Duroa
- (Kabupaten Buru) Dikumerasa