W
- (Kabupaten Biak Numfor) Wasribo
- (Kabupaten Biak Numfor) Wardori
- (Kabupaten Jayapura) Weversdorp
- (Kabupaten Keerom) Wembi
- (Kabupaten Jayapura) Wari
- (Kabupaten Jayapura) Waibron Baru
- (Kabupaten Jayapura) Waibronbono
- (Kota Jayapura) Waab
- (Kabupaten Jayapura) Warombam
- (Kabupaten Biak Numfor) Wadiboe
- (Kabupaten Keerom) Wor
- (Kabupaten Biak Numfor) Warsa
- (Kabupaten Supiori) Wandos
- (Kabupaten Kepulauan Yapen) Wandessi
- (Kabupaten Keerom) Wambersih
- (Kabupaten Sarmi) Wamiate
- (Kabupaten Biak Numfor) Wansra
- (Kabupaten Waropen) Wonti
- (Kabupaten Biak Numfor) Wombdisau
- (Kabupaten Biak Numfor) Warsadori
- (Kabupaten Biak Numfor) Warsa
- (Kabupaten Kepulauan Yapen) Warponwar
- (Kabupaten Biak Numfor) Waroi
- (Kabupaten Biak Numfor) Warido
- (Kabupaten Biak Numfor) Wari
- (Kabupaten Kepulauan Yapen) Wooi
- (Kabupaten Kepulauan Yapen) Wansema
- (Kabupaten Waropen) Woinui
- (Kabupaten Kepulauan Yapen) Wainap
- (Kabupaten Sarmi) Wageseri