B
- (Kabupaten Halmahera Barat) Baja
- (Kabupaten Halmahera Barat) Bakulu
- (Kabupaten Halmahera Barat) Bakun
- (Kabupaten Halmahera Utara) Balacai
- (Kabupaten Halmahera Utara) Balauting
- (Kabupaten Halmahera Utara) Bale
- (Kabupaten Halmahera Barat) Balisa
- (Kabupaten Halmahera Barat) Balisoan
- (Kabupaten Halmahera Selatan) Buli Besar
- (Kabupaten Halmahera Barat) Borona
- (Kabupaten Halmahera Utara) Buael
- (Kabupaten Halmahera Barat) Buaka
- (Kabupaten Halmahera Utara) Bubale
- (Kota Ternate) Buku Konora
- (East Halmahera Regency) Bukumatiti
- (Kabupaten Halmahera Barat) Bukumatiti
- (Kota Tidore Kepulauan) Bula
- (East Halmahera Regency) Buli
- (Kabupaten Halmahera Utara) Bore
- (East Halmahera Regency) Buli-Islam
- (Kabupaten Halmahera Selatan) Buli Kecil
- (Kabupaten Pulau Morotai) Buho Buho
- (Kabupaten Halmahera Selatan) Busu
- (Kabupaten Kepulauan Sula) Buya
- (Kabupaten Pulau Morotai) Bere Bere
- (Kabupaten Halmahera Selatan) Balitata
- (Kota Tidore Kepulauan) Bua-bua
- (Kabupaten Halmahera Tengah) Binongko
- (Kabupaten Pulau Morotai) Berebere
- (East Halmahera Regency) Besa