M
- (Võru vald) Mudakülä
- (Setomaa vald) Marinova
- (Rõuge vald) Mäe-Kilvagu
- (Setomaa vald) Meldova
- (Setomaa vald) Maaslova
- (Setomaa vald) Mustaoja
- (Võru vald) Madi
- (Võru vald) Muuga
- (Võru vald) Meeldemäe
- (Võru vald) Miiksaarõ
- (Võru vald) Marga
- (Võru vald) Mõlgamäe
- (Võru vald) Mäe-Vagula
- (Rõuge vald) Mallika
- (Rõuge vald) Missoküla
- (Rõuge vald) Möldre
- (Setomaa vald) Mokra
- (Setomaa vald) Määsovitsa
- (Setomaa vald) Määsi
- (Võru vald) Madala
- (Rõuge vald) Mäemurati
- (Setomaa vald) Mäessa
- (Rõuge vald) Mõtuskonnu
- (Rõuge vald) Märdi
- (Setomaa vald) Matsuri
- (Rõuge vald) Mauri
- (Setomaa vald) Meeksi
- (Rõuge vald) Metstaga
- (Võru vald) Möldri
- (Võru vald) Mõrgi