S
- (Põlva vald) Suukülä
- (Põlva vald) Saesaare
- (Kanepi vald) Sahkri
- (Räpina vald) Saarõ
- (Põlva vald) Soessaarõ
- (Põlva vald) Saiba
- (Räpina vald) Sarvemäe
- (Räpina vald) Silminitsa
- (Kanepi vald) Saviküla
- (Põlva vald) Sutinukk
- (Räpina vald) Saarõperä
- (Põlva vald) Saarjärve
- (Kanepi vald) Suuna
- (Põlva vald) Salatski
- (Kanepi vald) Sõra
- (Põlva vald) Sudeste
- (Kanepi vald) Suudla
- (Räpina vald) Suusaarõ
- (Kanepi vald) Suuna-Kiistu
- (Põlva vald) Säässaare
- (Räpina vald) Suure-Veerksu
- (Kanepi vald) Sulaoja
- (Räpina vald) Soohara
- (Kanepi vald) Sirvaste
- (Räpina vald) Sikakurmu
- (Põlva vald) Säkna
- (Põlva vald) Savimäe
- (Räpina vald) Saareküla
- (Räpina vald) Sülgoja
- (Põlva vald) Suurmetsa