R
- (Kose vald) Rõõsa
- (Raasiku vald) Rätla
- (Anija vald) Rasivere
- (Lääne-Harju vald) Rannaküla
- (Harku vald) Ranna
- (Saku vald) Rahula
- (Saue vald) Rahula
- (Jõelähtme vald) Ruu
- (Anija vald) Raudoja
- (Kose vald) Raveliku
- (Kose vald) Rava
- (Viimsi vald) Rivimaa
- (Tallinn) Rocca-al-Mare
- (Tallinn) Raku
- (Saue vald) Rehemetsa
- (Rae vald) Ruskvere
- (Saue vald) Ridaküla
- (Kuusalu vald) Rummu
- (Tallinn) Raudalu
- (Tallinn) Risti
- (Jõelähtme vald) Rebala
- (Lääne-Harju vald) Rummu
- (Anija vald) Rooküla
- (Jõelähtme vald) Rohusi
- (Lääne-Harju vald) Ristna
- (Lääne-Harju vald) Riidika
- (Kose vald) Riidamäe
- (Kose vald) Ridaküla
- (Anija vald) Rekka
- (Kuusalu vald) Rehatse